El protagonista es Alain, un entrenador Pokémon que junto a su Charizard tiene el objetivo de ir mejorando con ayuda de la megaevolución, que le permite tener a Mega-Charizard X. También tiene como objetivo común con su superior Lysson (secreto líder del Team Flare) desvelar el misterio de la megaevolución. En su viaje se encuentra con Mairin, quién se auto proclama como su compañera de viaje, y con Steven le acompañan por un tiempo.
El Charizard de Alain tiene una charizardita X. Entre los entrenadores contra los que se enfrentará se encuentra Narciso, miembro del Alto Mando de Kalos y Steven Stone, campeón de la Liga de Hoenn.